Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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