Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tgm1Q9JLF6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tgm1Q9JLF6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tgm1Q9JLF6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tgm1Q9JLF6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tgm1Q9JLF6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm1Q9JLF6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms