Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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SacsQ9JLC8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SacsQ9JLC8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SacsQ9JLC8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SacsQ9JLC8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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