Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccr10Q9JL21 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr10Q9JL21 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms