Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hip1rQ9JKY5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hip1rQ9JKY5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hip1rQ9JKY5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hip1rQ9JKY5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hip1rQ9JKY5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hip1rQ9JKY5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms