Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms