Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trem1Q9JKE2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trem1Q9JKE2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem1Q9JKE2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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