Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms