Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms