Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms