Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Kcnmb4Q9JIN6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Kcnmb4Q9JIN6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Kcnmb4Q9JIN6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Kcnmb4Q9JIN6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms