Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms