Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms