Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms