Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms