Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp4Q9ER80 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms