Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall1Q9ER74 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall1Q9ER74 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall1Q9ER74 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sall1Q9ER74 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sall1Q9ER74 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms