Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms