Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Barx1Q9ER42 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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