Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rapgef4Q9EQZ6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rapgef4Q9EQZ6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rapgef4Q9EQZ6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rapgef4Q9EQZ6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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