Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms