Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf1Q9EPU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms