Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rp2Q9EPK2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms