Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aph1cQ9DCZ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms