Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne8Q9DC53 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms