Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrotQ9DC50 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms