Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms