Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrpraQ9DBG7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms