Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smg9Q9DB90 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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