Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA48

Spaca1, Sperm acrosome membrane-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spaca1Q9DA48 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spaca1Q9DA48 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spaca1Q9DA48 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms