Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Q9D8Q6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms