Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin37Q9D8N6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms