Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkbh4Q9D8F1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms