Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med11Q9D8C6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms