Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Jam3Q9D8B7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms