Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms