Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms