Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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