Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D7E4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D7E4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D7E4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9D7E4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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