Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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MsraQ9D6Y7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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MsraQ9D6Y7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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MsraQ9D6Y7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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MsraQ9D6Y7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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MsraQ9D6Y7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms