Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms