Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm5Q9D6G9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm5Q9D6G9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms