Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb4aQ9D6F9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb4aQ9D6F9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4aQ9D6F9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms