Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc81Q9D5W4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms