Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D5Q8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms