Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a3Q9D554 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms