Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam227bQ9D518 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms