Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms