Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4W2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms