Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms